Il cuore della chiesa è costituito dall’altare centrale, a partire dal quale viene tracciata la pianta centralizzata esagonale irregolare , che organizza la forma avvolgente dell’assemblea e gli spazi liturgici sussidiari. Tre vani circolari  – posti a tre vertici dell’esagono longitudinalizzato dell’aula, e disposti su due livelli – sono destinati a ospitare il tabernacolo, il battistero e le confessioni, le immagini devozionali, gli spazi per la preghiera in piccoli gruppi; ai livelli inferiori sono utilizzati come elementi distributivi per il raccordo con la cripta e i vani nel basamento. I volumi cilindrici generati tali spazi determinano le tre ampie absidi a profilo poligonale e coronate da un’asola luminosa, caratterizzanti l’inserimento dell’edificio nel contesto urbano.

La forza dell’impianto liturgico e dello schema geometrico di base pongono in secondo piano il tema del programma iconografico.Il crocifisso segna l’asse longitudinale dell’edificio, a raccordare visivamente la mensa d’altare e la cappella eucaristica sopraelevata; uno degli spazi circolari sussidiari viene utilizzato per le statue devozionali tradizionali. L’esigenza di alcune immagini per il culto, manifestatasi nel corso dei decenni, è sempre stata declinata con soluzioni piuttosto provvisorie, e non sempre coerenti con l’insieme; attualmente la memoria figurativa della santa titolare è posta sul setto sinistro tra la navata e la cappella circolare, con un’effige che richiama le icone orientali. Una via crucis è disposta lungo le pareti perimetrali dell’aula.

Il progetto dell’illuminazione naturale costituisce uno dei fattori più interessanti nel rapporto tra spazio liturgico e struttura architettonica. Al di sopra della pedana dei principali poli liturgici si innalza il tetto , costituito da tre prismi a base esagonale irregolare, sovrapposti ruotati di 60° e dimensionalmente degradanti verso l’alto secondo un rapporto di 1:2. La luce piove dalle pareti laterali dei tre tiburi, filtrata da elementi in vetro-cemento colorato. Con le parole di Giovanna Maria Zuccotti, progettista dell’opera e docente di applicazioni di geometria descrittiva al Politecnico: “Ciascuno degli ordini principali è costituito da un prisma, avente per base un esagono irregolare a lati uguali, ma ad angoli alternativamente disuguali (100° e 140°), concluso da una copertura a falde la cui linea di imposta è orizzontale, per i tratti dei lati dell’esagono che convergono ai tre vertici posti sui tre principali assi di simmetria dell’organizzazione geometrica ed architettonica dei volumi, mentre è inclinata per i tratti di lato convergenti ai tre rimanenti vertici dell’esagono. […] Al di sotto di ciascuna cuspide, formata dai tratti di falda a linea di imposta inclinata dell’ordine principale, si aggrega una porzione di prisma, avente per base un poligono regolare di diciotto lati, coperta da una porzione di cono, avente asse verticale coincidente con lo spigolo del prisma dell’ordine principale e generatrice parallela alla linea di imposta della falda sovrastante” (Zuccotti 1985, p. 158). Se la geometria della struttura è definita degli architetti progettisti, l’intervento dello strutturista Giuseppe Raineri ha consentito di eliminare le catene intrecciate a vista sopra lo spazio dell’aula, portandole nella piastra basamentale.

Il centro parrocchiale è chiamato ad assolvere una pluralità di funzioni religiose e sociali, che devono essere organizzate su un lotto ampio, ma disposto su un’area fortemente longitudinale. La soluzione progettuale isola la chiesa nella parte nord dell’isolato, dopo la demolizione della preesistente casa parrocchiale degli anni Trenta: la chiesa è circondata da vie su tre lati, su una piattaforma di circa 70 x 70 metri sollevata su di più di 2 metri, costituita dalla cripta preesistente (utilizzata successivamente per le attività ricreative) e dai vani annessi, in cui si sistemano le opere parrocchiali (allestite nel 1962) e la cappella feriale (con accesso autonomo su via Caboto). La disposizione del resto del complesso è esito di un’idea complessiva unitaria, realizzata nel corso degli anni: lungo il lato est dell’isolato è collocata la nuova casa del parroco (nella forma di piccolo edificio autonomo realizzato già nel 1959, collegato alla chiesa tramite la manica degli uffici), gli spazi aperti per il gioco (su un’ampia autorimessa seminterrata , affittata per sostenere le spese di costruzione del complesso) e – alla testata sud (via Torricelli) – una scuola con casa religiosa (realizzata nel 1963), disposta su uno sviluppo verticale di sette piani, inserita nello skyline adiacente.

Come sopra accennato, la storia liturgica dell’edificio è segnata dalla sperimentazione. Nel corso dei decenni, la pedana centrale per l’altare “ha subito diverse modificazioni risultate però sempre compatibili sia con la struttura dell’interno sia con l’intento di favorire la partecipazione attiva dei fedeli alle celebrazioni (intento ben presente alle origini della progettazione cinque anni prima che il Concilio Vaticano II fosse indetto): in un primo tempo l’altare di tipo tradizionale  – spalle ai fedeli – con soprastante tabernacolo, ripiani per candelieri, tronetto per il Santissimo Sacramento provvisorio in legno, consentì alla metà dei presenti di assistere di fianco alle celebrazioni; in un secondo tempo (immediato postconcilio) un nuovo altare provvisorio in legno, lasciato libero da ogni sovrastruttura, risultò molto adatto alla celebrazione orientata verso l’ingresso principale; in un terzo tempo l’altare attuale fu realizzato in termini definitivi al centro del presbiterio della chiesa con lo stesso materiale lapideo del pavimento, nello stesso punto dove si era collocato il primo altare postconciliare” (Varaldo 2001, p. 389).Il tabernacolo e lo spazio per l’adorazione sono collocati sulla piattaforma a est dell’altare, sopra la sacrestia .